Cúrcuma

Genoma completo do cloroplasto da planta Stahlianthus Involucratus (Zingiberaceae)


. 23 de julho de 2019; 4 (2): 2702-2703.
doi: 10.1080 / 23802359.2019.1644227.

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Dong-Mei Li et al. Recurso de DNA B mitocondrial. .

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Resumo

O primeiro genoma completo do cloroplasto de Stahlianthus involucratus (Zingiberaceae) foi relatada neste estudo. O S. involucratus o genoma do cloroplasto tinha 163.300 bp de comprimento e consistia em uma região de cópia única grande (LSC) de 87.498 bp, região de uma cópia única pequena (SSC) de 15.568 bp e um par de regiões de repetição invertida (IR) de 30.117 bp. Codificou 141 genes, incluindo 87 genes codificadores de proteínas (79 espécies de PCG), 46 genes de tRNA (28 espécies de tRNA) e 8 genes de rRNA (4 espécies de rRNA). A análise filogenética baseada em polimorfismos de nucleotídeo único apoiou fortemente que S. involucratus, Curcuma roscoeana e Curcuma longa formou um aglomerado em grupo CurcumaII dentro da família Zingiberaceae.

Palavras-chave: Stahlianthus involucratus; Zingiberaceae; genoma do cloroplasto; Análise filogenética; Polimorfismo de nucleotídeo único.

Declaração de conflito de interesse

Nenhum potencial conflito de interesse foi relatado pelos autores.

Figuras

Figura 1.
Figura 1.

Árvore filogenética construída com matrizes de polimorfismos de nucleotídeo único a partir de genomas de cloroplastos de 14 espécies usando o método de máxima verossimilhança. Os valores de bootstrap foram baseados em 1.000 réplicas e são indicados ao lado das ramificações. Números de adesão: Alpinia zerumbet JX088668, Alpinia oxyphylla NC_035895.1, Curcuma flaviflora KR967361, Zingiber espectável JX088661, Curcuma roscoeana NC_022928.1, Curcuma longa MK262732, Kaempferia galanga MK209001, Kaempferia elegans MK209002, Amomum kravanh NC_036935.1, Amomum compactum NC_036992.1, Costus pulverulentus KF601573, Cuba verde MK262733 e Canna indica KF601570.

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