Propriedades conformacionais da melatonina e dois agonistas conformacionalmente restritos: uma mecânica molecular e estudo espectroscópico de NMR

O hormônio melatonina (N-acetil-5-metoxitriptamina) tem sido implicado na regulação de vários processos neurais e endócrinos que são causados ​​pela mudança diária no fotoperíodo. As propriedades conformacionais da melatonina e de dois agonistas conformacionalmente restritos, 8-metoxi-2-acetamidotetralina e cis-1-metil-8-metoxi-2-acetamidotetralina, foram examinadas como ponto de partida para estudos SAR. A análise conformacional foi realizada por meio de cálculos de mecânica molecular (campo de força MM2-85) usando um procedimento de construção passo a passo e o programa de modelagem molecular MacroModel (que possui uma versão modificada do campo de força MM2) para Monte Carlo e buscas sistemáticas em árvores. A espectroscopia de NMR foi usada para avaliar o comportamento conformacional em solução. Os três métodos de pesquisa foram complementares e produziram uma boa descrição das características conformacionais. Os dois campos de força produziram geometrias diferentes de algumas conformações de baixa energia e também energias estéricas relativas diferentes. Ao usar o campo de força MM2-85, uma interação intramolecular entre a amida-H e o sistema aromático reduz as energias relativas de várias conformações da melatonina e das 2-amidotetralinas. No entanto, experimentos de RMN indicaram que essas interações, que podem ser muito importantes in vacuo, não são importantes na solução.