Perfil do transcriptoma de Curcuma longa L. cv. Suvarna


A cúrcuma é uma cultura com valor econômico, devido à sua utilidade nas indústrias alimentícia, farmacêutica e na medicina ayurvédica, atraindo a atenção em muitas áreas de trabalho de pesquisa. No presente estudo, executamos o resequenciamento por meio da montagem do transcriptoma do cúrcuma cultivar Suvarna (CL_Suv_10). O resequenciamento da variedade Suvarna gerou dados brutos de 5 Gbases com sequência emparelhada de 75 bp. Os dados brutos foram submetidos ao banco de dados SRA do NCBI com o número de acesso SRR4042181. As leituras foram montadas usando a ferramenta Cufflinks-2.2.1 que resultou em 42994 números de transcrições. O comprimento das transcrições variou de 83 a15565, com valor N50 de 1216 e comprimento médio da transcrição de 773. As transcrições foram anotadas por meio de número de bancos de dados. Pela primeira vez, o perfil de transcriptoma da cultivar Suvarna foi feito, o que poderia ajudar na identificação de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) entre Suvarna e outras cultivares de cúrcuma para sua identificação autêntica.

Palavras-chave: Curcuma longa; RNA-seq; Suvarna; Transcriptome.



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