Levantamento e caracterização de genes NBS-LRR (R) no transcriptoma de Curcuma longa

Os genes de resistência estão entre as classes de genes mais importantes para fins de melhoramento de plantas, sendo responsáveis ​​pela ativação dos mecanismos de defesa das plantas. Entre eles, os genes da classe R do sítio de ligação de nucleotídeo rico em leucina (NBS-LRR) são os mais abundantes e ativamente encontrados em todos os tipos de plantas. A caracterização insilico da base de dados EST resultou na detecção de 28 sequências do gene R do tipo NBS em Curcuma longa. Todas as 28 sequências representaram o domínio NB-ARC, 21 dos quais apresentaram características de motivo altamente conservadas e categorizadas como genes NBS regulares. Os Quadros de Leitura Aberta variaram de 361 (CL.CON.3566) a 112 (CL.CON.1267) com uma média de 279 aminoácidos. A maior parte do alinhamento ocorreu com monocotiledôneas (67,8%) com ênfase nas sequências de Oryza sativa e Zingiber. Todos os melhores alinhamentos com dicotiledôneas ocorreram com Arabidopsis thaliana, Populus trichocarpa e Medicago sativa. Estes Rgenes do tipo NBS detectados de Curcuma longa podem ser usados ​​como um recurso valioso para o desenvolvimento de marcadores moleculares, mapeamento molecular de genes R e identificação de análogos de genes de resistência e caracterização funcional e evolutiva de genes de resistência que codificam NBS-LRR em plantas de reprodução assexuada .