Curcumina se ligando a beta amiloide: um estudo computacional

A curcumina, um constituinte químico presente na cúrcuma, é conhecida por prevenir a agregação do peptídeo amilóide implicado na fisiopatologia da doença de Alzheimer. Embora a curcumina seja conhecida por se ligar diretamente a vários agregados amilóides, nenhuma investigação sistemática foi realizada para compreender sua capacidade de se ligar aos agregados amilóides, incluindo oligômeros e fibrilas. Neste estudo, construímos modelos computacionais de (i) hexapeptídeo Aβ (16) KLVFFA (21) conjunto de folha β de zíper estérico de octâmero e (ii) conjunto de folha β de fibrila Aβ de comprimento total. A ligação da curcumina nesses modelos foi avaliada por estudos de simulação de docking molecular e dinâmica molecular (MD). Em ambos os modelos, a curcumina foi orientada em uma conformação linear estendida paralela ao eixo da fibra e exibiu melhor estabilidade no modelo hexapeptídeo Aβ (16) KLVFFA (21) octâmero steric-zipper (Ebinding = -10,05 kcal / mol) em comparação com full- modelo de fibrila Aβ de comprimento (Ebinding = -3,47 kcal / mol). A análise das trajetórias de MD da curcumina ligada à fibrila Aβ de comprimento total mostra boa estabilidade com desvios mínimos de RMSD do átomo Cα. Curiosamente, a ligação da curcumina levou a flutuações marcadas na região (14) HQKLVFFA (21) que constitui a espinha da fibrila com valores de RMSF variando de 1,4 a 3,6 Å. Estes resultados mostram que a ligação da curcumina a Aβ altera o equilíbrio na via de agregação, promovendo a formação de agregados não tóxicos.