cientistas: cientistas desenvolvem aplicativo de smartphone para analisar genoma de coronavírus – Últimas Notícias
“Nem todo mundo tem acesso aos recursos de computação de alta potência necessários para a análise de DNA e RNA, mas a maioria das pessoas tem acesso a um smartphone”, disse Ira Deveson, do Garvan Institute of Medical Research, na Austrália.
“A análise genômica rápida e em tempo real é mais crucial hoje do que nunca, como um método central para rastrear a propagação de coronavírus. Nosso aplicativo torna a análise genômica mais acessível, literalmente colocando a tecnologia nos bolsos de cientistas de todo o mundo “, disse Deveson.
Os pesquisadores testaram o Genopo nos dados de sequenciamento brutos de amostras de vírus isoladas de nove pacientes de Sydney infectados com SARS-CoV-2.
Eles extraíram e amplificaram o RNA do vírus de uma amostra de swab, sequenciando o DNA amplificado com um dispositivo sequenciador MinION e analisando os dados em um smartphone.
O aplicativo Genopo levou em média 27 minutos para determinar a sequência completa do genoma do SARS-CoV-2 a partir dos dados brutos, o que os pesquisadores dizem que abre a possibilidade de fazer análises genômicas no ponto de atendimento, em tempo real.
Os pesquisadores também mostraram que o Genopo pode ser usado para determinar o perfil de metilação do DNA – uma modificação que altera a atividade do gene – em uma amostra do genoma humano.
“Isso ilustra uma arquitetura flexível e eficiente que é adequada para executar muitas ferramentas de bioinformática populares e acomodar genomas pequenos ou grandes”, disse Deveson.
“Esperamos que isso torne a genômica muito mais acessível aos pesquisadores para desbloquear as informações no DNA ou RNA em benefício da saúde humana, inclusive no atual pandemia“, Acrescentou Deveson.
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