Análise filogenética do gene matK do cloroplasto de Zingiberaceae para código de barras de DNA de plantas

O gene MaturaseK (MatK) do cloroplasto é altamente conservado na sistemática de plantas que está envolvida no splicing do intron do Grupo II. O tamanho do gene é de 1500 bp de comprimento, localizado no íntron de trnK. No presente estudo, o gene matK de Zingiberaceae foi utilizado para a análise de variantes, sítio de parcimônia, padrões, taxas de transição / tranversão e filogenia. A família das Zingiberaceae compreende 47 gêneros com valores medicinais. A sequência do gene matK foi obtida do banco de genomas e usada para a análise. Os alinhamentos de sequência foram realizados pelo Clustal X, as taxas de transição / transversão foram previstas por MEGA e as análises filogenéticas foram realizadas pelo pacote PHYLIP. O resultado indica que os gêneros Zingiberaceae Afromonum, Alpinia, Globba, Curcuma e Zingiber apresentam polifilogenia. As variantes globais entre as espécies são de 24% e a taxa de transição / transversão é de 1,54. A árvore filogenética foi projetada para identificar as regiões ideais que poderiam ser usadas para definir as relações inter e intera-genéricas. A partir deste estudo, pode-se concluir que o gene matK é um bom candidato para o código de barras do DNA da família de plantas Zingiberaceae.