Abordagem in silico para a identificação de inibidores potenciais de Curcuma amada Roxb contra H. pylori: triagem ADMET e estudos de docking molecular

Introdução: O presente estudo tenta identificar potenciais alvos de H. pylori para novos inibidores da erva terapêutica, gengibre manga (Curcuma amada Roxb.). Métodos: A estrutura cristalina de todos os alvos de drogas selecionados obtidos do Protein Data Bank (PDB) foram submetidos a docking molecular contra um total de 130 compostos (encontrados para ter atividade biológica contra H. pylori ) foram recuperados de bancos de dados públicos. Os compostos com boa afinidade de ligação foram selecionados para o resgate Prime MM-GBSA e simulação de dinâmica molecular (MD). A lista final de compostos foi feita para as previsões de ADMET. Resultados: Com base na afinidade de ligação denotada pelo glide score e eficiência do ligante, os compostos de manga e gengibre foram considerados seletivos para a shiquimato quinase e a desidroquinase do tipo II por meio de ligações de hidrogênio e interações de ponte salina. A estabilidade das interações e cálculos de energia livre pelos resultados do Prime MM-GBSA confirmaram a afinidade dos compostos de gengibre da manga tanto para a shikimat quinase quanto para a desidroquinase tipo II. A partir dos resultados acima, 15 compostos foram calculados para os parâmetros ADMET, regra de cinco de Lipinski, e os resultados foram considerados promissores, sem quaisquer limitações. Simulações de MD identificaram o ácido gentísico como composto de sucesso para a shiquimato quinase de H. pylori. Conclusão: O estudo atual pode identificar o em sílico potencial dos compostos de manga e gengibre contra alvos de shikimato quinase e desidroquinase tipo II para H. pylori infecções e são adequados para em vitro e na Vivo avaliação.