Triagem de compostos antivirais, projeto de peptídeos e construção de rede de proteínas do vírus influenza A (cepa a / Puerto Rico / 8/1934 H1N1)

A terapia antiviral baseada em plantas é a necessidade atual de gerenciamento holístico de cuidados de saúde, que pode ser alcançada por meio da triagem de fitoquímicos e do desenvolvimento de peptídeos antivirais. Existem certos fatores do hospedeiro que estão diretamente envolvidos na rápida replicação viral, causando uma pandemia mundial. Um total de 177 fitoquímicos de Ocimum sanctum (L.), Tinospora cordifolia (Thunb.) Miers, Cinnamomum camphora (L.) J. Presl., Allium sativum (L.), Curcuma longa (L.) e Aloe vera ( L.) Burm. f. foram avaliados quanto à sua afinidade para todas as proteínas virais de H1N1. Aplicando filtros de drogas e mantendo o limite de tais filtros em relação aos padrões, 82 compostos foram considerados adequados para análise posterior. O sistema de pontuação de consenso foi usado para rastrear os ligantes principais de 82 compostos, que rastrearam os 12 compostos principais. Regiões altamente conservadas (> 80%) que eram hidrofílicas, flexíveis, antigênicas e também carregadas foram selecionadas como peptídeos antivirais potentes. As proteínas virais foram tomadas como alvos para os peptídeos modelados para docking proteína-proteína. Além disso, a rede de interação patógeno-hospedeiro foi construída para revelar os fatores do hospedeiro envolvidos na replicação viral, a partir dos quais grupos de proteínas únicos que representam seu envolvimento na reprodução viral foram selecionados por meio de mapeamento com bancos de dados de vias. Doze compostos e cinco peptídeos foram considerados altamente eficazes contra todas as proteínas do H1N1. Com base na singularidade, 13 grupos de proteínas foram obtidos que estão envolvidos no processo celular, a saber, reprodução viral, metabolismo da frutose-6-fosfato, metabolismo do composto de nitrogênio, biossíntese, processo celular, desenvolvimento de oligodendrócitos, localização, processo de multiorganismo, metabolismo primário, resposta à proteína desdobrada, metabolismo e resposta à proteína e catabolismo.