Novos insights de triagem virtual computacional retratam o potencial de ligação de fitoterápicos selecionados contra prováveis ​​alvos de drogas de Clostridium difficile

Este estudo explora a triagem computacional e abordagens de acoplamento molecular para a triagem de novas terapias à base de ervas contra prováveis ​​alvos de drogas do Clostridium difficile. Os genes essenciais foram previstos por análise comparativa do genoma de C. difficile e dos melhores organismos homólogos usando a pesquisa BLAST no banco de dados de genes essenciais (DEG). As funções desses genes em várias vias metabólicas foram previstas e alguns desses genes foram considerados como alvos potenciais. Três proteínas principais foram selecionadas como alvos putativos, nomeadamente o componente IIC da permease, o transportador ABC e a histidina quinase. As estruturas tridimensionais desses alvos foram previstas por modelagem molecular. Os compostos bioativos à base de plantas foram avaliados por triagem virtual auxiliada por computador e os potenciais de ligação contra os alvos da droga foram previstos por docking molecular. Quercetina presente em Psidium guajava (energia de ligação de -9,1 kcal / mol), ácido elágico encontrado em Punica granatum e Psidium guajava (energia de ligação -9,0 kcal / mol) e Curcumina, presente em Curcuma longa (energia de ligação -7,8 kcal / mol) demonstrou energia de ligação mínima e mais número de resíduos interagindo com os alvos da droga. Além disso, o estudo comparativo revelou que os fitoligandos demonstraram melhores afinidades de ligação aos alvos da droga em comparação com os ligantes usuais. Assim, esta investigação explora as probabilidades terapêuticas de fitoligandos selecionados contra os supostos alvos de drogas de C. difficile.