Classificação e análise comparativa de marcadores de sequências expressas de Curcuma longa L. (ESTs) que codificam proteínas ricas em glicina (GRPs)
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Bioinformação. 2012.
Artigo PMC grátisResumo
Proteínas ricas em glicina (GRPs) são um grupo de proteínas caracterizado por seu alto conteúdo de resíduos de glicina que ocorrem frequentemente em blocos repetitivos. Os diversos padrões de expressão e localização subcelular de vários GRPs sugerem sua implicação em diferentes processos fisiológicos. Vários GRPs foram isolados e caracterizados de diferentes monocotiledôneas e dicotiledôneas. No entanto, pouca ou nenhuma informação está disponível sobre a estrutura e função dos GRPs em plantas de reprodução assexuada. Neste estudo, a análise in-silico do banco de dados de tags de sequência expressa resultou no isolamento de cinquenta e um GRPs de Curcuma longa L., uma planta reprodutível assexuadamente de grande significado medicinal e econômico. A análise filogenética agrupou os GRPs em quatro classes distintas com base em motivos conservados e na natureza das repetições ricas em glicina. A maioria dos GRPs isolados exibiu alta homologia com GRPs conhecidos de outras plantas que são expressos em resposta a vários estresses. A presença de alta diversidade estrutural e peptídeo sinal em alguns GRPs sugere seu papel fisiológico diverso e localização específica no tecido. As sequências isoladas podem ser usadas como uma estrutura para clonagem, caracterização e análise expressional de GRPs em resposta a vários estresses bióticos e abióticos em Curcuma longa, bem como outras plantas de reprodução assexuada.
Palavras-chave: Curcuma longa; GRPs; TBLASTN; tags de sequência expressa.
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Referências
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