Avaliação das relações genéticas de variedades de Curcuma alismatifolia usando marcadores de repetição de sequência simples

O gênero Curcuma é um membro da família do gengibre (Zingiberaceae), que recentemente se tornou popular para uso como vasos de flores, tanto em ambientes internos quanto como plantas de pátio e de paisagem. Usamos marcadores moleculares baseados em PCR (SSRs) para elucidar a variação genética e as relações entre cinco variedades de Curcuma (Curcuma alismatifolia) cultivadas na Malásia. Dos primers testados, 8 (de 17) primers SSR foram selecionados por sua reprodutibilidade e altas taxas de polimorfismo. O número de alelos presumidos revelados pela análise SSR variou de dois a seis alelos, com um valor médio de 3,25 alelos por loco. Os valores de HO e HE variaram de 0 a 0,8 (valor médio de 0,2) e 0,1837 a 0,7755 (valor médio de 0,5102), respectivamente. Oito primers SSR produziram 26 fragmentos amplificados no total e revelaram altas taxas de polimorfismo entre as variedades estudadas. O conteúdo de informação polimórfica variou de 0,26 a 0,73. O coeficiente de similaridade de dados foi calculado para todas as comparações de pares e usado para construir um método de grupo de pares não ponderados com dendrograma de média aritmética (UPGMA). Valores de coeficiente de similaridade de 0,2105 a 0,6667 (com média de 0,4386) foram encontrados entre as cinco variedades examinadas. Uma análise de cluster de dados usando um algoritmo UPGMA dividiu as cinco variedades / híbridos em 2 grupos.