Sequência genômica completa e organização de um novo micovírus de Phoma matteuccicola cepa LG915

O genoma completo de um micovírus de dupla fita (dsRNA), Phoma matteuccicola partitivirus 1 (PmPV1) foi sequenciado. Consiste em dois segmentos de dsRNA, 1664 bp (dsRNA-1) e 1383 bp (dsRNA-2) de comprimento, cada um contendo uma única estrutura de leitura aberta (ORF) que codifica potencialmente uma proteína de 46,78 kDa e uma proteína de 40,92 kDa, respectivamente . dsRNA-1 codifica um polipeptídeo putativo com um domínio conservado de RNA polimerase dependente de RNA (RdRp) que mostra similaridade de sequência com as proteínas correspondentes de partitivírus. A proteína codificada pelo dsRNA-2 não tem semelhança significativa com as proteínas de revestimento típicas (CPs) dos partitivírus, mas a análise da estrutura sugere que ela pode funcionar como uma proteína de revestimento. As partículas virais purificadas de PmPV1 eram isométricas e tinham aproximadamente 29 nm de diâmetro. A análise filogenética mostrou que PmPV1 está intimamente relacionado a membros do gênero Gammapartitivirus dentro da família Partitiviridae, mas forma um ramo separado com o vírus 1 de RNA de Colletotrichum acutatum e partitivírus de Ustilaginoidea virens 2. Este é o primeiro relato da sequência de nucleotídeos de comprimento total de um romance vírus do gênero Gammapartitivirus infectando P. matteuccicola cepa LG915, o agente causal da mancha das folhas de Curcuma wenyujin.