Caracterização e análise filogenética do genoma completo do cloroplasto de Curcuma longa (Zingiberaceae)

Curcuma longa, uma planta medicinal tradicional bem conhecida na China, pertence ao gênero Curcuma família Zingiberaceae. Neste estudo, nós primeiro montamos o genoma completo do cloroplasto de C. longa baseado em sequências das plataformas de sequenciamento Illumina e PacBio. Obtivemos o genoma completo do cloroplasto com comprimento total de 162.176 bp. Consistia em uma grande região de cópia única (LSC, 86.984 bp), uma pequena região de cópia única (SSC, 15.694 bp) e um par de repetições invertidas (IRs, 29.749 bp cada). As análises de sequência indicaram que o genoma do cloroplasto continha 111 genes distintos, incluindo 79 genes codificadores de proteínas, 28 genes de tRNA e quatro genes de rRNA. A composição de nucleotídeos era assimétrica (31,62% A, 18,42% C, 17,79% G, 32,18% T) com um conteúdo total de AT de 63,80%. Os conteúdos de AT das regiões LSC, SSC e IR foram 66,00%, 70,35% e 58,85%, respectivamente. Dezesseis genes possuíam um único íntron, enquanto outros dois genes tinham dois íntrons. A análise filogenética indicou que C. longa estava intimamente relacionado com as espécies Curcuma roscoeana dentro do gênero Curcuma na família Zingiberaceae.