Autenticação de espécies de Curcuma (Zingiberaceae) com base em sequências de rDNA 18S nuclear e trnK de plastídio

As drogas da curcuma têm sido usadas de forma discriminatória para revigorar a circulação sanguínea, promover a digestão e como colagógico na China. No entanto, há confusão sobre as origens botânicas da droga e usos clínicos por causa da semelhança morfológica das plantas e drogas Curcuma. O sequenciamento comparativo do gene 18S rRNA no DNA ribossômico nuclear (rDNA) e do gene trnK no DNA do cloroplasto (cpDNA) foi realizado a fim de examinar a filogenia interespécies e identificar, em última instância, as espécies de Curcuma. Um total de cem acessos de dezoito espécies foram analisados. Isso resultou em uma matriz alinhada de 1810 pb para o rDNA 18S e 2 800 pb para trnK. A divergência de sequência de rDNA 18S dentro do grupo interno variou de 0-0,05%, trnK variou de 0-0,19%. Um sítio substituído por transversão de base (da citosina para a timina) foi observado a montante do rDNA 18S na posição 234 do nucleotídeo em C. kwangsiensis e na população japonesa de C. zedoaria que separou a distância genética de outros taxa de Curcuma. Duas regiões não codificantes embutidas no íntron trnK mostraram maior variabilidade, incluindo substituições de nucleotídeos, repetição de inserção e deleções. Com base no consenso de relacionamento, dezoito linhagens principais dentro de Curcuma são reconhecidas no nível de espécie. Os resultados sugerem que Curcuma é monofilético com 100% de suporte bootstrap e irmão dos gêneros Hedychium e Zingiber. As sequências trnK mostraram variações consideráveis ​​entre as espécies de Curcuma e, portanto, foram reveladas como um candidato promissor para o código de barras das espécies de Curcuma, que fornecem caracteres valiosos para inferir relações dentro das espécies, mas são insuficientes para resolver relações entre táxons intimamente relacionados.