Sequenciamento de transcriptoma e caracterização funcional de novas sesquiterpeno-sintases de Curcuma wenyujin
Afiliações
Item na área de transferência
Arch Biochem Biophys. .
Abstrato
Os tubérculos de Curcuma wenyujin são ricos em óleos essenciais, principalmente vários sesquiterpenos, apresentando efeitos antibacterianos, antivirais e antitumorais. No entanto, o mecanismo molecular de C. wenyujin é deficiente e as sesquiterpeno-sintases relacionadas ainda não estão claras. Neste estudo, os dados do transcriptoma de tubérculos e folhas de C. wenyujin foram obtidos e montados em 78 092 unigenes. Destes, foi previsto que 244 unigenes estivessem envolvidos na biossíntese de terpenóides, enquanto 131 unigenes foram categorizados como o termo “Biossíntese de estrutura terpenóide” (TBB). Vinte e dois unigenes possuíam o domínio da terpeno-sintase; cinco foram preditos como sesquiterpeno-sintases. Dos 208 unigenes anotados como citocromos P450, 8 unigenes com sequências de codificação de comprimento total faziam parte do clado CYP71 que pode realizar principalmente hidroxilações de metabólitos especializados. Além disso, Dez DEGs relacionados ao suprimento do precursor C5 e à síntese de sesquiterpeno foram validados por PCR em tempo real; que mostrou uma correspondência próxima com a sequência do transcriptoma. Uma nova germacreno B sintase (CwGBS) e α-santaleno sintase (CwSS) foram identificados na engenharia metabólica de E. coli. Este estudo proporcionou a primeira análise comparativa do transcriptoma de novo de tecidos de folhas e tubérculos de C. wenyujin, com o objetivo de compreender os mecanismos genéticos. Genes-chave envolvidos na biossíntese de sesquiterpeno ajudarão a revelar os mecanismos subjacentes de C. wenyujin.
Palavras-chave: Curcuma wenyujin; Germacrene B; Sesquiterpeno sintases; Transcriptoma.
Copyright © 2021. Publicado pela Elsevier Inc.
Declaração de conflito de interesse
Declaração de concorrentes de interesse Os financiadores não tiveram qualquer papel na concepção do estudo; na coleta, análise ou interpretação dos dados; na redação do manuscrito, ou na decisão de publicar os resultados. Os autores declaram que não conhecem interesses financeiros concorrentes ou relações pessoais que possam ter influenciado o trabalho relatado neste artigo.
Source link
