Um locus de metilação associado a MIR4646 é hipometilado na depressão adolescente

Fundo: Estudos de epigenética e atividade transcricional em adolescentes podem fornecer conhecimento sobre possíveis estratégias preventivas da depressão.

Métodos: Apresentamos um estudo de associação de todo o metiloma (MWAS) e uma análise de validação de coorte de depressão em adolescentes, em duas coortes separadas: descoberta (n = 93) e conjunto de dados de validação 1 (n = 78). O padrão de metilação de todo o genoma foi medido a partir do sangue total usando o array Illumina 450K. Uma segunda coorte de validação, conjunto de dados de validação 2, consiste em biópsias cerebrais post-mortem de adultos deprimidos (n = 58). Realizamos um MWAS por meio de regressões lineares múltiplas robustas de metilação para uma avaliação de pontuação de risco modificada de depressão. Os níveis de metilação dos sítios CpG candidatos foram correlacionados com os níveis de expressão do gene associado em uma coorte independente de 11 voluntários saudáveis.

Resultados: O estado de metilação de dois locais CpG previu classificações confiáveis ​​de depressão em adolescentes (cg13227623 e cg04102384) (p <10E-06). A análise de validação de coorte confirmou que cg04102384 - localizado na região promotora do microRNA 4646 (MIR4646) - está hipometilado no conjunto de dados de validação 1 e no conjunto de dados de validação 2 (p <0,05). Cg04102384 foi inversamente correlacionado aos níveis de expressão de MIR4646-3p em controles saudáveis ​​(p <0,05).

Limitações: MIR4646 não foi diferencialmente expresso em um subconjunto de amostras com depressão adolescente medida por medições de qRT-PCR.

Conclusão: Identificamos um local específico de risco epigenético associado a MIR4646 a ser associado à depressão em adolescentes. Cg04102384 supostamente regula a expressão gênica de MIR4646-3p. A predição do gene alvo e a análise da super-representação do conjunto de genes revelaram o envolvimento deste miRNA no alongamento dos ácidos graxos, um processo relacionado aos ácidos graxos ômega-3, previamente associado à depressão.