Triagem in silico de fitocompostos naturais para a identificação de compostos de chumbo potenciais para tratar COVID-19
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Abstrato
COVID-19 é um dos membros da família dos coronavírus que pode facilmente atacar humanos. Até agora, 10 milhões de pessoas estão infectadas e mais de dois milhões de pessoas morreram de COVID-19 em todo o mundo. No ano passado, vários pesquisadores fizeram avanços essenciais na descoberta de drogas potenciais. Até agora, nenhum medicamento eficiente está disponível no mercado. O presente estudo tem como objetivo identificar os potentes fitocompostos de diferentes plantas medicinais (Zingiber officinale, sementes de cominho, cominho, Pimenta preta, Curcuma longa, e Allium sativum) No total, 227 fitocompostos foram identificados e avaliados contra as proteínas S-ACE2 e M pró através de abordagens de triagem virtual baseadas em estrutura. Com base na pontuação de afinidade de ligação, 30 fitocompostos ativos foram selecionados. Entre eles, a afinidade de ligação para beta-sitosterol e beta-elemene contra S-ACE2 apresentou -12,0 e -10,9 kcal / mol, respectivamente. Enquanto isso, a afinidade de ligação para beta-sitosterol e beta-clorogenina contra M pró verificou-se ser -9,7 e -8,4 kcal / mol, respectivamente. Além disso, os compostos selecionados prosseguiram com simulação de dinâmica molecular, análise primária de MM-GBSA e verificações de propriedade ADME / T para compreender a estabilidade, interação, mudanças conformacionais, energia livre de ligação e parâmetros farmacêuticos relevantes. Além disso, os resíduos do ponto de acesso, como Lys31 e Lys353 para S-ACE2 e díade catalítica His41 e Cys145 para M pró estavam ativamente envolvidos na inibição da entrada viral. A partir das análises in silico, antecipamos que este trabalho pode ser valioso para a descoberta de novos medicamentos em andamento com potencial tratamento para COVID-19.
Palavras-chave: COVID-19; S-ACE2; protease principal; simulação de dinâmica molecular; plantas medicinais naturais; triagem virtual baseada em estrutura.
Copyright © 2021 Sankar, Ramachandran, Pandi, Mutharasappan, Ramasamy, Prabu, Shanmugaraj, Wang, Muniyandai, Rathinasamy, Chandrasekaran, Bayan, Jeyaraman, Halliah e Ebenezer.
Declaração de conflito de interesse
Os autores declaram que a pesquisa foi realizada na ausência de quaisquer relações comerciais ou financeiras que pudessem ser interpretadas como um potencial conflito de interesses.
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