Resequenciamento de Curcuma longa L. cv. Kedaram, por meio do perfil do transcriptoma, revela várias transcrições de romance

Curcuma longa L. (Cúrcuma), da família Zingiberaceae, é uma das espécies de plantas economicamente e medicinalmente importantes. É uma cultura de especiarias estéril, poliplóide e propagada vegetativamente, cultivada geralmente no sudeste da Ásia. No presente estudo, realizamos o re-sequenciamento por meio do perfil do transcriptoma de Curcuma longa cv. Kedaram (Cl_Ked_6). Adquirimos um total de 1 GB de dados brutos por meio de novo sequenciamento por meio de sequenciamento emparelhado usando a plataforma Nextseq 500. Os dados brutos obtidos neste estudo podem ser acessados ​​no banco de dados NCBI com o número de acesso SRR3928562 com o número de acesso do bioprojeto PRJNA324755. A ferramenta Cufflinks-2.2.1 foi usada para a montagem do transcriptoma que resultou em 39.554 números de transcrições. O comprimento da transcrição variou de 76 a 15.568, com valor N50 de 1221 e comprimento médio da transcrição de 860. Anotamos as transcrições usando vários bancos de dados. Esses dados serão benéficos para estudar variações de sequência, particularmente SNPs entre cultivares de açafrão, para a identificação autêntica e a descoberta de novos transcritos funcionais em Kedaram.