Predição dos mecanismos antiinflamatórios da curcumina por análise de rede de interação de proteínas baseada em módulo

23 de março de 2021 Agora

doi: 10.1016 / j.apsb.2015.09.005. Epub, 21 de outubro de 2015.

Afiliações

¹ Base de reprodução do Laboratório Estadual Chave de Pesquisa Sistemática, Desenvolvimento e Utilização de Recursos da Medicina Chinesa, Escola de Farmácia, Universidade de Medicina Tradicional Chinesa de Chengdu, Chengdu 611137, China.
² Escola de Farmácia Chinesa, Universidade de Medicina Chinesa de Pequim, Pequim 100102, China.
³ Faculdade de Ciências e Medicina do Esporte, Universidade Técnica de Munique, Munique, Alemanha.

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Yanxiong Gan et al. Acta Pharm Sin B. Novembro 2015.

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doi: 10.1016 / j.apsb.2015.09.005. Epub, 21 de outubro de 2015.

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¹ Base de reprodução do Laboratório Estadual Chave de Pesquisa Sistemática, Desenvolvimento e Utilização de Recursos da Medicina Chinesa, Escola de Farmácia, Universidade de Medicina Tradicional Chinesa de Chengdu, Chengdu 611137, China.
² Escola de Farmácia Chinesa, Universidade de Medicina Chinesa de Pequim, Pequim 100102, China.
³ Faculdade de Ciências e Medicina do Esporte, Universidade Técnica de Munique, Munique, Alemanha.

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Resumo

A curcumina, o componente clinicamente ativo da Curcuma longa (cúrcuma), é amplamente usada para tratar doenças inflamatórias. A análise da rede de interação de proteínas (PIN) foi usada para prever seus mecanismos de ação molecular. Alvos de curcumina foram obtidos com base nas bases de dados ChEMBL e STITCH. As interações proteína-proteína (PPIs) foram extraídas do banco de dados String. O PIN da curcumina foi construído pelo Cytoscape e os módulos de função identificados por análise de enriquecimento de ontologia gênica (GO) com base na detecção de complexo molecular (MCODE). Um PIN de curcumina com 482 nós e 1.688 interações foi construído, o qual possui propriedades modulares e de pequeno mundo sem escala. Com base na análise desses módulos de função, o mecanismo da curcumina é proposto. Dois módulos foram encontrados intimamente associados à inflamação. Com a análise dos módulos de função, os efeitos antiinflamatórios da curcumina foram relacionados ao SMAD, ERG e mediação pela família TLR. TLR9 pode ser um alvo potencial da curcumina para tratar a inflamação.

Palavras-chave: Anti-inflamatório; Curcumina; Cytoscape; ETS, específico para a transformação de eritroblastos; GO, ontologia genética; Análise de enriquecimento de ontologia genética; IFNs, interferões; IL, interleucina; JAK-STAT, Janus quinase-STAT; MAPK, proteína quinase ativada por mitogênio; MCODE, detecção de complexo molecular; Módulo; Detecção de complexo molecular; Mecanismo molecular; NF-κB, fator nuclear kappa B; PIN, rede de interação de proteínas; PPIs, interações proteína-proteína; Rede de interação de proteínas; STATs, transdutor de sinal e ativador de complexos de transcrição; TLR, receptor toll-like.

Figuras

Figura 1 — **figura 1**
A rede de proteínas da curcumina. Os nós e bordas indicam as proteínas e seus relacionamentos. Os nós cinza representam nós de semente e os brancos são nós que interagem com os nós de semente.

**Figura 2**
Propriedades topológicas da rede. (A) Distribuição em graus da rede da curcumina; (B) distribuição do comprimento do caminho mais curto da rede de curcumina.

Fig. 3 — **Figura 3**
Módulos no PIN da curcumina. Com o algoritmo MCODE, 19 módulos foram extraídos da rede. Os nós cinza apresentam nós de semente e os brancos são nós que interagem com os nós de semente.

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