Cúrcuma

A sequência completa do genoma do cloroplasto de Cautleya gracilis


A primeira sequência completa do genoma do cloroplasto (cpDNA) de Cautleya Gracilis foi determinada a partir de dados de sequenciamento de extremidades de pares HiSeq da Illumina neste estudo. O cpDNA tem 164.001 pb de comprimento, contém uma grande região de cópia única (LSC) de 89.271 pb e uma pequena região de cópia única (SSC) de 15.984 pb, que foram separadas por um par de regiões de repetição invertida (IR) de 29.373 bp. O genoma contém 131 genes, incluindo 85 genes codificadores de proteínas, 8 genes de RNA ribossômico e 38 genes de RNA de transferência. O conteúdo geral de GC de todo o genoma é 36,1% e os valores correspondentes das regiões LSC, SSC e IR são 33,8, 29,4 e 41,3%, respectivamente. Uma análise filogenômica posterior mostrou que C. gracilis perto do gênero Curcuma na família Zingiberaceae.

Palavras-chave: Cautleya gracilis; Sequenciamento Illumina; cloroplasto; Análise filogenética.



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